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      一種新型豬細(xì)小病毒的鑒定和基因組特征分析

      時(shí)間:2023-10-07   訪問量:1061

      豬細(xì)小病毒(PPVs)是一類小型非包膜病毒,目前已發(fā)現(xiàn)7種基因型(PPV1-7)。本研究通過高通量測(cè)序(HTS)技術(shù),從廣東省豬繁殖與呼吸綜合征病毒陽性樣本中初步鑒定出一種新型PPV,暫命名為PPV8。PPV8-GDJM2021的近全長(zhǎng)基因組長(zhǎng)度為4380bp,有兩個(gè)重疊的開放閱讀框(ORF),分別編碼NS1和VP1。測(cè)序結(jié)果表明:PPV8在基因組水平上與PPV1-7的同源性為16.23%-44.18%,與PPV1的同源性相對(duì)最高;PPV8-GDJM2021與PPV1和豬bufavirus(PBuV)NS1蛋白序列同源性為31.86-32.68%,與原細(xì)小病毒屬成員相鄰,形成一個(gè)獨(dú)立的分支。在1990—2021年收集的211份臨床樣本中,有37份樣本(17.5%)檢出PPV8,這些樣本分布于我國12個(gè)地區(qū),時(shí)間跨度長(zhǎng)達(dá)24年(1998—2021年)。


      原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36204286/












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